2017基因大数据专业课题项目(12月)

实习 2017-10-12 14:19:38

2017基因大数据专业课题项目(12月)

2017.12.01-2017.12.30(远程)

 

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一、项目背景

自人类启动基因组计划以来,各项工程已逐步开始揭示人类基因组与疾病间关联的奥秘。随着测序技术的不断进步,仅用1000美元即可识别出基因组。

海量的数据会给计算分析和存储带来前所未有的压力,有分析估计,基因组学很快就能超过YouTube的数据量。在医疗档案中整合基因组数据主要是为医生对疾病的诊治提供参考,其中一个应用是药物基因组学。临床药物基因组学实施联盟(CPIC)分析了药物和基因的关系,将相关信息存储在 PharmGKB数据库中,并可供临床使用。

基因大数据分析,是精准医疗及生物统计领域极为重要的组成部分,是计算机科学,生物科学,医学和生物统计学之间的相互作用的领域。

本课题由中科院北京基因组所专业团队指导,学习基因大数据专业技术,并撰写英文专利。

 

二、项目亮点

1、国际级平台:

 

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中科院北京基因组所

基因组科学与信息重点实验室立足基因组科学前沿,整合各类组学的研究优势,发展基因组科学新理论、新技术、新方法;精准基因组医学重点实验室针对人口健康和普惠健康体系建设的重大科研方向,立足中国人群肿瘤基因组等重大疾病的基因组学和精准医学研究;BIGD围绕国家精准医学和重要战略生物资源的组学数据,发展组学大数据系统构建、挖掘与分析的新技术、新方法,建设组学大数据汇交、应用与共享平台。

2、成果导向的专业课题:

本次活动学生们会在专家带领下,深入学习基因大数据技术的发展史,及在精准医学及生物统计的应用进展。运用计算机及基因分析相关技术(blast 、BWA -Samtools、GATK、Python、ANNOVAR等等),处理实验数据,并撰写英文专利,完成专利申请。

 

 

Innovation Patent

 

3、专家推荐信:

通过小组合作的形式,每个人细致扮演不同的研究角色、测序数据处理、数据分析、专利撰写等等方面互相协调,通力协作来解决问题。顺利通过的同学,将获得副研究员的个人推荐信。

 

4、高效的科研方式:

 

 

本次活动将使用基础知识学习+技术实践+专利申请的形式开展,在课题实践开展之前,我们会组织学生学习基因大数据处理、基因分析与高通量测序相关的基础知识,通读专业文献,进而引导学生完成技术实践,处理实验数据,并并撰写英文专利,完成专利申请。

有别于其他短期类培训项目,学生不仅学习专业知识,更重要的是亲自参与课题实践,并最终拿到专利,将活动的实践效果提升到最大!

 

三、适合人群

  • 申请目标专业为计算机、生物统计、医学等方向的学生。

  • 想要学习基因分析及计算机的专业方法,并提升科研实验能力的学生。

  • 想要丰富自己的计算机、生物统计、生物医学工程科研专业背景,深入发展自己兴趣点的学生。

四、基础信息

1、项目时间:

2017.12.01-2017.12.30(远程),不低于30课时的科研实操。

2. 项目安排:

  • W1: 课题背景材料及基础理论知识

  • W2: 分析方法及分析相关软件

  • W3: 数据分析

  • W4: 英文专利撰写及申请

3、项目费用:¥25,000元/人

费用包括:

  • a. 研究项目费用(包含导师理论培训费用、课题指导费用、实验材料费用和专利写作指导费用);

  • b. 课程介绍材料、课程文献材料;

  • c. 在课程结束后确保学生获得推荐信和完成专利申请;

  • d. 专利申请相关费用。

4、报名截止日期:2017.09.30

5、招生人数:4-6人

6、录取要求:英语成绩达到四级以上水平或托福80分以上或雅思6.0以上

7、实地实习:本课题组最优秀的学生将有机会免费到中科院自动化所实习一周,实习时间为2018年1月第三周或第四周。

 

 

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