寒假名校科研营——生物大数据方向

明德立人 理工 2017-07-18 16:16:34
寒假名校科研营——生物大数据方向


寒假名校科研营——生物大数据方向(基于生物大数据的分析、处理和计算)

项目简介

此实习项目专门为计划申请数据分析、生物学、生物医学、统计学、运筹学、应用数学、计算机科学、控制科学等交叉专业学科的学生所设计。学生将跟随中科院导师一同工作,了解生物大数据的基本概念,学习一门重要的编程语言,利用数据挖掘中的算法解决生物领域中的实际问题。实习结束后,导师会根据学生表现出具推荐信。

项目内容
本项目名称是基于大数据挖掘的网络药理学和人类复杂疾病预测研究。
1) 介绍克隆技术,DNA双螺旋结构的发现及人类基因组工程
2) 介绍组学技术的发展,生物信息学发展与前沿
3) 介绍生物大数据的基本概念,生物大数据在医学健康领域的重要作用
4) 学会利用相关数据库检索查找科研资料和生物数据
5) 介绍精准医学和个体化医疗
6) 介绍非编码RNA,非编码RNA与精准医学和药物研发, 非编码RNA资源数据库
7) 介绍生物信息学的概念,有意思的复杂网络
8) 简单介绍一门重要的编程语言,为后续动手实践做铺垫。
9) 案例研究,介绍一个基于信息科学算法解决复杂疾病治疗相关问题的经典案例。
10) 案例研究,介绍一个基于信息科学算法解决药物研发相关问题的经典案例。
11) 学生实现随机游走中的相关算法,并应用于具体生物数据和问题中,得到预测结果,实现对学生的考核。

师资背景
授课导师现任中国矿业大学教授、博导、中国矿业大学生物信息研究所所长、越崎学者,曾任中国科学院数学与系统科学研究院和国家数学与交叉科学中心助理研究员,2016年被中国矿业大学破格以越崎学者和教授身份人才引进。至今在Briefings in Bioinformatics (影响因子9.617,2篇,数学与计算生物学中科院一区,均为第一作者兼通讯作者)、Nucleic Acids Research (影响因子8.026) Oncotarget (影响因子 6.359,6篇,医学大类中科院一区,4篇第一作者,6篇通讯作者)、Bioinformatics (影响因子 5.323,数学与计算生物学中科院一区)、Plos Computational Biology(影响因子 4.62)、Nature旗下杂志Scientific Reports(影响因子 5.578, 6篇,均为第一作者兼通讯作者)等国际一流期刊发表论文36篇(SCI论文32篇,影响因子累计约155),其中第一作者23篇, 通讯作者24篇,发表论文被Nature Chemistry、Nature Reviews Endocrinology、Gut、Circulation、Circulation research、Trends in genetics、Pharmacology & Therapeutics、Briefings in Bioinformatics、Cancer research、Nucleic acids research等国际著名杂志引用共计637次,参编专著4部,获得授权专利1项,主持或以骨干身份参与国家自然科学基金重大研究计划、国家自然科学基金重点基金、国家自然科学基金青年基金、国家自然科学基金专项基金项目数学天元基金、中国矿业大学越崎学者人才引进项目等13项重要项目。担任36家国际主流杂志的编委、特约编委和审稿人。

招生对象及要求
优秀高中生,计划申请数据分析、生物学、生物医学、统计学、运筹学、应用数学、计算机科学、控制科学等相关专业,为了让学生可以更好的完成科研项目,项目组会以笔试和面试的形式对学生进行筛选

行程安排
时间1月17日-1月23日

 

日期 时间 项目进度 Lab相关
1月17日 下午 外地学生入住酒店,破冰活动,自我介绍,学生分组,导师进行项目简介  
1月18日 上午 项目开题,让学生了解项目,克隆技术,DNA双螺旋结构的发现及人类基因组工程 文献调研
下午 组学技术的发展和生物大数据、NCBI数据库简介和文献检索
1月19日 上午 生物大数据与人类健康 文献调研
下午 精准医学和个体化医疗、案例研究
1月20日 上午 非编码RNA简介、非编码RNA与精准医学和药物研发 文献调研
下午 非编码RNA资源数据库
1月21日 上午 生物信息学的概念、有意思的复杂网络 编程实现与文献调研
下午 利用随机游走算法预测miRNA和疾病之间的关联
1月22日 上午 根据实际生物数据编程实现RWRMDA算法 对于药物研发或者复杂疾病治疗相关问题,根据设计的算法进行计算机实验验证
下午 利用改进的随机游走算法预测药物靶点相互作用
1月23日 上午 根据实际生物数据编程实现NRWRH算法  
下午 总结与展望
 

备注:实际行程安排顺序可能会根据特定原因进行调整

点击查看更多  >>>>> 本科背景规划项目
 


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